CmapToolsissa on työkalu, jonka avulla on mahdollista järjestellä käsitekarttaa loogisesti.
Avatussa käsitekartassa:
Valitse Muotoilu -valikosta Automaattinen asettelu....
Jos haluat automaattisen asettelutoiminnon järjestävän koko käsitekartan, katso ettei käsitteitä tai linkki-ilmauksia ole valittuna.
Laajempien käsitekarttojen yhteydessä voit käyttää automaattista asettelutoimintoa valitsemalla tässä vaiheessa vain ne kartan osat, jotka haluat järjestellä.
Automaattinen asettelu -ikkuna avautuu.
Ikkunan yläosasta valittavat välilehdet tarjoavat käsitekartan asetteluun kaksi vaihtoehtoista tapaa (hierarkkinen ja vahvuussuunnattu).
Hierarkkisen asettelun valinnat asettelevat kartan strukturoidusti organisoiden ja jättävät käsitekartan olemassaolevan asettelun usein huomiotta.
Vahvuussuunnatun asettelun valinnat pienentävät objektien väliin jääviä etäisyyksiä ja säilyttävät käsitekartan alkuperäisen asettelun.